研究概要
研究室について
Links
リンク集 (Links)
よく使うツールなどへのリンク集です。
京都大学内
- 京都大学
- 農学研究科・農学部
- 応用生命科学専攻
- 農学研究科宇治地区（旧食研）
- 宇治地区事務部
- KULINE（京都大学蔵書検索）
- 全学メール（学生用）
- 農学研究科宇治地区共通機器 タンパク質構造機能相関解析システム
遺伝子・タンパク質関連ツール
- NCBI (遺伝子・タンパク質配列のデータベースなど)
- UniProt (タンパク質配列のデータベース)
- NEBCutter
- Webcutter
- Protein Explorer
- ExPASy ProtParam tool
- JaMBW （等電点計算などのツール集）
- Prediction Servers (CBS, DTU Bioinformatics)
- EGassembler（サービス終了）
- CAP3 Sequence Assembly Program
- Reverse Complement
- Webtools for PCR and oligonucleotides
- CAZY
構造解析ツール
- Protein Data Bank
- BioKids Wiki
- CCP4
- Coot
- Phenix
- The Dundee PRODRG Server
（廃止されたようなのでCCP4のSkethcher等またはPhenixのeLBOWで辞書を作成しています） - PDB2PQR Server
- AlphaFold Server (立体構造予測 AlphaFold3)
- AutoDock Vina (ドッキングシミュレーション)
フリーフォント・フリーウェア・オンラインツール
- 自作フォント IncoUDJP（インコ・ユニバーサルデザイン日本語プログラミングフォント）
- プログラミングフォント Ricty ShinDiminished（リクティ・シン・ディミニッシュト：漢字拡張版）
- プログラミングフォント Ricty Diminished（リクティ・ディミニッシュト：非公式最新版）
- プログラミング用フォント Ricty（リクティ）
- Nasuフォント（等幅のNasuMフォントがプログラミング用）
- Miguフォント（等幅のMigu 1M, Migu 2Mがプログラミング用）
- Google Fonts（ Inconsolata, BIZ UDGothic, Noto Sans Monoなど）
- sitemap.xml Editor（サイトマップを作成-自動生成ツール）
放射光施設
文献・各種検索
- PubMed
- SCOPUS
- Science Direct
- CiNii Research
- J-STAGE
- ライフサイエンス辞書
- Protocol-Online
- 蛋白質科学会アーカイブ
- DeepL翻訳ツール
外部図書館
卒業生・修了生
応用構造生物学分野（廣瀬研究室・三上研究室）の卒業生・修了生で、大学で研究を続けておられる先生方です。
同窓会業務で連絡が取れない場合は下記の先生方にお問い合わせください。